Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbxip1Q3TVI8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms