Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ccdc136Q3TVA9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms