Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms