Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG1

Rhox4c, MCG125587, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4cQ2MDG1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox4cQ2MDG1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox4cQ2MDG1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms