Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YGL102CYGL102C 429 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YGR042WYGR042W 816 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 RPL24BYGR148C 468 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YGR219WYGR219W 342 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 SDH3YKL141W 597 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 PRS1YKL181W 1284 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 GCD7YLR291C 1146 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 AAD14YNL331C 1131 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 MBF1YOR298C-A 456 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 ATP4YPL078C 735 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 MUM2YBR057C 1101 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YCL007CYCL007C 393 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 MGA1YGR249W 1371 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 ASN2YGR124W 1719 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 FUM1YPL262W 1467 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 PPM2YOL141W 2088 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 UIP5YKR044W 1332 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YLR446WYLR446W 1302 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 SAG1YJR004C 1953 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 SFH5YJL145W 885 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 NPA3YJR072C 1158 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YKL115CYKL115C 393 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YMR010WYMR010W 1218 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 IAH1YOR126C 717 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 DFR1YOR236W 636 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 EDE1YBL047C 4146 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 TAD1YGL243W 1203 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 RPL27AYHR010W 411 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 LNP1YHR192W 837 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 MNN11YJL183W 1269 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 FBA1YKL060C 1080 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 BOS1YLR078C 735 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 PRM9YAR031W 897 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 CDC123YLR215C 1083 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 SNO1YMR095C 675 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 SRV2YNL138W 1581 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 UTR2YEL040W 1404 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 SNU23YDL098C 585 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 UBC6YER100W 753 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YGL138CYGL138C 1038 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 MED6YHR058C 888 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 AIM20YIL158W 615 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YLR049CYLR049C 1287 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 GSP1YLR293C 660 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 SHE1YBL031W 1017 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YBL077WYBL077W 432 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 MPP6YNR024W 561 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 TMA46YOR091W 1038 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 MPD1YOR288C 957 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YPR015CYPR015C 744 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 ISC1YER019W 1434 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 KNS1YLL019C 2214 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YCR085WYCR085W 354 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 HED1YDR014W-A 489 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 GLC7YER133W 939 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 HEM2YGL040C 1029 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 ATG36YJL185C 882 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 MRP49YKL167C 414 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 ICT1YLR099C 1185 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 TEM1YML064C 738 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 COS3YML132W 1140 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YBL071CYBL071C 309 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YNL320WYNL320W 855 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 ATP19YOL077W-A 207 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YOR114WYOR114W 885 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 CST26YBR042C 1194 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 SEC62YPL094C 825 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YBR116CYBR116C 528 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 ICS2YBR157C 768 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 COS2YBR302C 1140 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YOS9YDR057W 1629 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 FRE5YOR384W 2085 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 ICP55YER078C 1536 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 COQ1YBR003W 1422 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YEN1YER041W 2280 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 COX20YDR231C 618 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 CNN1YFR046C 1086 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 SEH1YGL100W 1050 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 RTA1YGR213C 954 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 RPP1YHR062C 882 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 SQT1YIR012W 1296 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 CYS3YAL012W 1185 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 AUR1YKL004W 1206 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YML083CYML083C 1257 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YML099W-AYML099W-A 330 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 ARG1YOL058W 1263 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 ERG10YPL028W 1197 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 SPC29YPL124W 762 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 ITT1YML068W 1395 nt5.96□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 THI2YBR240C 1353 nt5.96□□□□□ -1.45
TY1A-NL1Q12391 MRPL1YDR116C 858 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 BUD19YJL188C 309 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 VPS24YKL041W 675 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 KAE1YKR038C 1161 nt5.96□□□□□ -1.46
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