Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VgfQ0VGU4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VgfQ0VGU4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VgfQ0VGU4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VgfQ0VGU4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VgfQ0VGU4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VgfQ0VGU4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VgfQ0VGU4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VgfQ0VGU4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VgfQ0VGU4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VgfQ0VGU4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VgfQ0VGU4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VgfQ0VGU4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VgfQ0VGU4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms