Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc162pQ0VG85 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms