Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt80Q0VBK2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt80Q0VBK2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms