Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms