Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Vps8Q0P5W1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Vps8Q0P5W1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms