Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnma1Q08460 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms