Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms