Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms