Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NrepQ07475 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NrepQ07475 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NrepQ07475 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms