Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rcn1Q05186 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms