Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col6a2Q02788 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms