Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb5Q02739 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms