Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RykQ01887 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RykQ01887 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RykQ01887 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RykQ01887 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RykQ01887 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RykQ01887 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RykQ01887 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RykQ01887 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RykQ01887 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RykQ01887 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RykQ01887 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RykQ01887 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RykQ01887 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RykQ01887 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RykQ01887 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RykQ01887 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RykQ01887 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RykQ01887 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RykQ01887 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RykQ01887 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RykQ01887 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RykQ01887 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RykQ01887 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RykQ01887 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RykQ01887 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RykQ01887 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RykQ01887 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RykQ01887 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RykQ01887 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RykQ01887 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RykQ01887 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RykQ01887 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RykQ01887 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RykQ01887 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RykQ01887 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RykQ01887 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RykQ01887 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RykQ01887 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RykQ01887 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RykQ01887 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RykQ01887 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RykQ01887 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RykQ01887 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RykQ01887 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RykQ01887 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RykQ01887 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RykQ01887 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RykQ01887 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RykQ01887 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RykQ01887 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RykQ01887 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RykQ01887 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RykQ01887 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RykQ01887 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RykQ01887 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RykQ01887 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RykQ01887 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RykQ01887 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RykQ01887 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RykQ01887 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RykQ01887 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RykQ01887 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RykQ01887 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RykQ01887 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RykQ01887 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RykQ01887 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RykQ01887 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RykQ01887 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RykQ01887 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RykQ01887 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RykQ01887 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RykQ01887 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RykQ01887 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RykQ01887 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RykQ01887 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RykQ01887 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RykQ01887 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RykQ01887 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RykQ01887 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RykQ01887 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RykQ01887 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RykQ01887 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RykQ01887 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RykQ01887 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RykQ01887 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RykQ01887 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RykQ01887 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RykQ01887 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RykQ01887 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RykQ01887 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RykQ01887 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RykQ01887 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RykQ01887 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RykQ01887 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RykQ01887 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RykQ01887 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RykQ01887 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RykQ01887 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RykQ01887 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms