Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mc1rQ01727 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms