Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serpina1cQ00896 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpina1cQ00896 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpina1cQ00896 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpina1cQ00896 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms