Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psmb4P99026 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb4P99026 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms