Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bmp1P98063 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bmp1P98063 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bmp1P98063 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bmp1P98063 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bmp1P98063 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bmp1P98063 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bmp1P98063 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bmp1P98063 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bmp1P98063 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bmp1P98063 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bmp1P98063 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms