Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AlkP97793 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
AlkP97793 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
AlkP97793 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
AlkP97793 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
AlkP97793 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
AlkP97793 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AlkP97793 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
AlkP97793 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AlkP97793 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
AlkP97793 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
AlkP97793 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
AlkP97793 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
AlkP97793 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
AlkP97793 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AlkP97793 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AlkP97793 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
AlkP97793 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
AlkP97793 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AlkP97793 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
AlkP97793 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AlkP97793 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AlkP97793 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AlkP97793 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AlkP97793 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
AlkP97793 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AlkP97793 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AlkP97793 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AlkP97793 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
AlkP97793 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AlkP97793 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AlkP97793 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
AlkP97793 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AlkP97793 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AlkP97793 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
AlkP97793 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AlkP97793 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AlkP97793 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AlkP97793 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AlkP97793 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
AlkP97793 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
AlkP97793 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
AlkP97793 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AlkP97793 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
AlkP97793 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AlkP97793 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
AlkP97793 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
AlkP97793 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
AlkP97793 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AlkP97793 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AlkP97793 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
AlkP97793 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
AlkP97793 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AlkP97793 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
AlkP97793 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
AlkP97793 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
AlkP97793 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
AlkP97793 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
AlkP97793 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
AlkP97793 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
AlkP97793 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AlkP97793 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
AlkP97793 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AlkP97793 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AlkP97793 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AlkP97793 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
AlkP97793 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
AlkP97793 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
AlkP97793 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AlkP97793 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
AlkP97793 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
AlkP97793 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AlkP97793 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AlkP97793 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AlkP97793 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
AlkP97793 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
AlkP97793 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
AlkP97793 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
AlkP97793 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
AlkP97793 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
AlkP97793 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
AlkP97793 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
AlkP97793 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
AlkP97793 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AlkP97793 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
AlkP97793 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
AlkP97793 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AlkP97793 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
AlkP97793 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
AlkP97793 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
AlkP97793 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
AlkP97793 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
AlkP97793 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
AlkP97793 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AlkP97793 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
AlkP97793 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AlkP97793 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AlkP97793 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AlkP97793 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AlkP97793 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms