Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrp1P97333 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrp1P97333 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms