Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H3f3aP84244 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms