Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Stra8P70278 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stra8P70278 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Stra8P70278 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stra8P70278 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stra8P70278 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stra8P70278 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms