Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad54lP70270 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms