Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Plxna3P70208 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plxna3P70208 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Plxna3P70208 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plxna3P70208 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna3P70208 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna3P70208 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna3P70208 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna3P70208 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna3P70208 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna3P70208 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna3P70208 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Plxna3P70208 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna3P70208 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna3P70208 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna3P70208 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna3P70208 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna3P70208 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna3P70208 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Plxna3P70208 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna3P70208 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Plxna3P70208 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna3P70208 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna3P70208 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna3P70208 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna3P70208 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Plxna3P70208 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna3P70208 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Plxna3P70208 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Plxna3P70208 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna3P70208 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna3P70208 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plxna3P70208 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plxna3P70208 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms