Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg1P63260 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg1P63260 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms