Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms