Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5bP61021 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5bP61021 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5bP61021 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5bP61021 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5bP61021 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms