Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm2P58774 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms