Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn4P57780 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn4P57780 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actn4P57780 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actn4P57780 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Actn4P57780 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actn4P57780 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actn4P57780 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Actn4P57780 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actn4P57780 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actn4P57780 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actn4P57780 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actn4P57780 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms