Protein–RNA interactions for Protein: P56567

Csta, Cystatin-A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CstaP56567 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CstaP56567 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CstaP56567 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CstaP56567 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CstaP56567 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CstaP56567 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CstaP56567 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CstaP56567 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CstaP56567 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CstaP56567 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CstaP56567 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CstaP56567 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CstaP56567 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CstaP56567 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CstaP56567 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CstaP56567 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CstaP56567 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CstaP56567 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CstaP56567 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CstaP56567 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CstaP56567 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CstaP56567 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CstaP56567 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CstaP56567 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CstaP56567 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CstaP56567 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CstaP56567 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CstaP56567 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CstaP56567 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CstaP56567 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CstaP56567 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CstaP56567 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CstaP56567 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CstaP56567 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CstaP56567 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CstaP56567 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CstaP56567 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CstaP56567 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CstaP56567 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CstaP56567 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CstaP56567 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CstaP56567 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CstaP56567 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CstaP56567 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CstaP56567 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CstaP56567 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CstaP56567 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CstaP56567 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CstaP56567 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CstaP56567 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CstaP56567 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CstaP56567 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CstaP56567 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CstaP56567 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CstaP56567 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CstaP56567 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CstaP56567 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CstaP56567 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CstaP56567 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CstaP56567 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CstaP56567 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CstaP56567 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CstaP56567 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CstaP56567 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CstaP56567 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CstaP56567 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CstaP56567 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CstaP56567 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CstaP56567 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CstaP56567 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CstaP56567 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CstaP56567 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CstaP56567 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CstaP56567 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CstaP56567 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CstaP56567 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CstaP56567 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CstaP56567 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CstaP56567 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CstaP56567 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CstaP56567 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CstaP56567 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CstaP56567 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CstaP56567 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CstaP56567 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CstaP56567 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CstaP56567 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CstaP56567 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CstaP56567 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CstaP56567 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CstaP56567 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CstaP56567 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CstaP56567 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CstaP56567 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CstaP56567 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CstaP56567 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CstaP56567 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CstaP56567 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CstaP56567 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CstaP56567 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms