Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms