Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2e3P52483 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms