Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbp3P49194 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 290.2 ms