Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CitP49025 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CitP49025 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CitP49025 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CitP49025 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CitP49025 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CitP49025 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CitP49025 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CitP49025 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CitP49025 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CitP49025 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CitP49025 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CitP49025 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CitP49025 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CitP49025 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CitP49025 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CitP49025 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CitP49025 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CitP49025 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CitP49025 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CitP49025 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CitP49025 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CitP49025 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CitP49025 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CitP49025 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CitP49025 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CitP49025 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CitP49025 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CitP49025 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CitP49025 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CitP49025 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CitP49025 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CitP49025 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CitP49025 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CitP49025 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CitP49025 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CitP49025 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CitP49025 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CitP49025 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CitP49025 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CitP49025 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CitP49025 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CitP49025 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CitP49025 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CitP49025 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CitP49025 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CitP49025 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CitP49025 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CitP49025 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CitP49025 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CitP49025 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CitP49025 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CitP49025 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CitP49025 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CitP49025 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CitP49025 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CitP49025 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CitP49025 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CitP49025 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CitP49025 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CitP49025 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CitP49025 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CitP49025 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CitP49025 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CitP49025 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CitP49025 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CitP49025 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CitP49025 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CitP49025 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CitP49025 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CitP49025 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CitP49025 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CitP49025 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CitP49025 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CitP49025 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CitP49025 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CitP49025 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CitP49025 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CitP49025 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CitP49025 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CitP49025 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CitP49025 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CitP49025 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CitP49025 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CitP49025 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CitP49025 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CitP49025 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CitP49025 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CitP49025 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CitP49025 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CitP49025 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CitP49025 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CitP49025 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CitP49025 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CitP49025 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CitP49025 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CitP49025 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CitP49025 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CitP49025 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CitP49025 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms