Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni3P48787 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms