Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edn3P48299 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edn3P48299 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edn3P48299 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edn3P48299 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edn3P48299 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edn3P48299 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edn3P48299 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edn3P48299 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edn3P48299 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edn3P48299 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edn3P48299 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edn3P48299 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn3P48299 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn3P48299 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edn3P48299 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edn3P48299 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edn3P48299 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Edn3P48299 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms