Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg3P47867 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg3P47867 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg3P47867 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scg3P47867 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scg3P47867 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scg3P47867 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scg3P47867 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scg3P47867 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg3P47867 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg3P47867 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg3P47867 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scg3P47867 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg3P47867 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg3P47867 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg3P47867 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms