Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmx2P43687 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmx2P43687 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms