Protein–RNA interactions for Protein: P43267

Sox15, Protein SOX-15, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox15P43267 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox15P43267 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox15P43267 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox15P43267 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox15P43267 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox15P43267 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms