Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3caP42337 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pik3caP42337 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pik3caP42337 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pik3caP42337 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pik3caP42337 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3caP42337 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3caP42337 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3caP42337 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3caP42337 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3caP42337 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3caP42337 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3caP42337 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms