Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csf3rP40223 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csf3rP40223 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csf3rP40223 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csf3rP40223 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csf3rP40223 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms