Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 YEN1YER041W 2280 nt5.64□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 AGA1YNR044W 2178 nt5.64□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 NCS6YGL211W 1080 nt5.63□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 ERP2YAL007C 648 nt5.63□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 PDR10YOR328W 4695 nt5.62□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 SYP1YCR030C 2613 nt5.62□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 BUD25YER014C-A 462 nt5.62□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 PUS5YLR165C 765 nt5.61□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 DSS4YPR017C 432 nt5.61□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 MAL11YGR289C 1851 nt5.6□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 RAD28YDR030C 1521 nt5.6□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 DPH1YIL103W 1278 nt5.59□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 SUR2YDR297W 1050 nt5.59□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 AUA1YFL010W-A 285 nt5.59□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 FLC1YPL221W 2382 nt5.58□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 PAL1YDR348C 1500 nt5.58□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 DAL4YIR028W 1908 nt5.58□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 ZPR1YGR211W 1461 nt5.58□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 CWC2YDL209C 1020 nt5.58□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 COQ4YDR204W 1008 nt5.57□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 NTR2YKR022C 969 nt5.57□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 FMP46YKR049C 402 nt5.57□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 OTU1YFL044C 906 nt5.56□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 DAL7YIR031C 1665 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 YDR306CYDR306C 1437 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 YGL214WYGL214W 486 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 TIF34YMR146C 1044 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 YLR446WYLR446W 1302 nt5.54□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 TDA1YMR291W 1761 nt5.54□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 YKL023WYKL023W 834 nt5.54□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 SPO19YPL130W 672 nt5.54□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 AIP1YMR092C 1848 nt5.54□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 GCR1YPL075W 2358 nt5.54□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 MBR1YKL093W 1020 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 RSF1YMR030W 1131 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 YDR445CYDR445C 408 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 IGO2YHR132W-A 396 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 DAN1YJR150C 897 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 GTT2YLL060C 702 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 CWC25YNL245C 540 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 CAB3YKL088W 1716 nt5.52□□□□□ -1.52
YRF1-2P40105 RNR3YIL066C 2610 nt5.52□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 SEA4YBL104C 3117 nt5.52□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 RPS14AYCR031C 414 nt5.52□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YHR173CYHR173C 339 nt5.52□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 IMD2YHR216W 1572 nt5.52□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 CEX1YOR112W 2286 nt5.51□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YGL072CYGL072C 360 nt5.51□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 JHD2YJR119C 2187 nt5.51□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 SPC105YGL093W 2754 nt5.51□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 DAL81YIR023W 2913 nt5.51□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 SWC3YAL011W 1878 nt5.51□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YMR221CYMR221C 1515 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 VPS68YOL129W 555 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YBR053CYBR053C 1077 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 TAF5YBR198C 2397 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 VAS1YGR094W 3315 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 CRT10YOL063C 2874 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 HIS4YCL030C 2400 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 RSC58YLR033W 1509 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YFL068WYFL068W 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 HMX1YLR205C 954 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 RET3YPL010W 570 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 KIN4YOR233W 2403 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 AIM3YBR108W 2844 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 FBP1YLR377C 1047 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 PXA1YPL147W 2613 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 CYM1YDR430C 2970 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 CAF16YFL028C 870 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 NAT2YGR147C 867 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 NMT1YLR195C 1368 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YHR182WYHR182W 2358 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 YJL206CYJL206C 2277 nt5.47□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 TRP1YDR007W 675 nt5.47□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 NUP42YDR192C 1293 nt5.47□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt5.47□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt5.47□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt5.47□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt5.47□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt5.47□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt5.47□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.3 ms