Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf1P39428 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf1P39428 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf1P39428 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf1P39428 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf1P39428 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Traf1P39428 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf1P39428 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf1P39428 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf1P39428 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf1P39428 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf1P39428 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms