Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig1P37913 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig1P37913 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig1P37913 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig1P37913 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lig1P37913 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig1P37913 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig1P37913 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig1P37913 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig1P37913 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig1P37913 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig1P37913 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig1P37913 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig1P37913 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig1P37913 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms