Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfc1P35601 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rfc1P35601 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfc1P35601 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfc1P35601 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfc1P35601 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfc1P35601 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfc1P35601 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfc1P35601 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfc1P35601 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfc1P35601 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfc1P35601 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfc1P35601 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfc1P35601 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfc1P35601 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfc1P35601 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfc1P35601 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfc1P35601 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfc1P35601 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfc1P35601 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfc1P35601 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfc1P35601 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfc1P35601 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfc1P35601 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfc1P35601 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfc1P35601 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfc1P35601 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfc1P35601 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rfc1P35601 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfc1P35601 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfc1P35601 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfc1P35601 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfc1P35601 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfc1P35601 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfc1P35601 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfc1P35601 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms