Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin1P35438 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin1P35438 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin1P35438 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin1P35438 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin1P35438 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin1P35438 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin1P35438 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin1P35438 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin1P35438 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms